Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A1P11836 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MS4A1P11836 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms