Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNB1P11230 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB1P11230 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms