Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARAP10276 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARAP10276 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARAP10276 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARAP10276 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARAP10276 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARAP10276 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARAP10276 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARAP10276 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARAP10276 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms