Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBSLP0DN79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBSLP0DN79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms