Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAA2P0DJI9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAA2P0DJI9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms