Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGA3P0DJD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGA3P0DJD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PGA3P0DJD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PGA3P0DJD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PGA3P0DJD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms