Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBBP0CG47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms