Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM228BP0C875 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms