Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD48P09326 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD48P09326 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD48P09326 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD48P09326 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD48P09326 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD48P09326 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD48P09326 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD48P09326 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD48P09326 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD48P09326 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD48P09326 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms