Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP10P09238 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP10P09238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MMP10P09238 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP10P09238 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP10P09238 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP10P09238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP10P09238 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP10P09238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP10P09238 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP10P09238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP10P09238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP10P09238 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP10P09238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP10P09238 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP10P09238 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP10P09238 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP10P09238 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP10P09238 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms