Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPRAP08240 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPRAP08240 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPRAP08240 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms