Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALB1P05937 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALB1P05937 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALB1P05937 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALB1P05937 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALB1P05937 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALB1P05937 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALB1P05937 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALB1P05937 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALB1P05937 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALB1P05937 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALB1P05937 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALB1P05937 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALB1P05937 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALB1P05937 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms