Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRB1P04280 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRB1P04280 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRB1P04280 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRB1P04280 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRB1P04280 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRB1P04280 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRB1P04280 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms