Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHBGP04278 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHBGP04278 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHBGP04278 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHBGP04278 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHBGP04278 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHBGP04278 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHBGP04278 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHBGP04278 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms