Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTNP04004 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTNP04004 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VTNP04004 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTNP04004 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTNP04004 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTNP04004 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VTNP04004 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VTNP04004 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTNP04004 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTNP04004 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTNP04004 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VTNP04004 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VTNP04004 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VTNP04004 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTNP04004 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTNP04004 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTNP04004 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTNP04004 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTNP04004 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTNP04004 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms