Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP1P03956 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP1P03956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP1P03956 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP1P03956 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP1P03956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP1P03956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP1P03956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP1P03956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP1P03956 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMP1P03956 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP1P03956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP1P03956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms