Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A1P02730 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms