Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01737 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01737 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01737 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01737 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01737 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01737 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms