Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EGFRP00533 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EGFRP00533 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EGFRP00533 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EGFRP00533 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EGFRP00533 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EGFRP00533 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EGFRP00533 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EGFRP00533 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EGFRP00533 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EGFRP00533 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EGFRP00533 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EGFRP00533 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms