Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX11BO96011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX11BO96011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms