Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR4O95977 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR4O95977 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR4O95977 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms