Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBB3O95704 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APBB3O95704 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBB3O95704 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBB3O95704 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBB3O95704 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBB3O95704 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBB3O95704 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBB3O95704 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBB3O95704 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBB3O95704 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBB3O95704 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms