Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD1O95696 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD1O95696 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD1O95696 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD1O95696 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD1O95696 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD1O95696 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD1O95696 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRD1O95696 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRD1O95696 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRD1O95696 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRD1O95696 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRD1O95696 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRD1O95696 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD1O95696 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms