Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CBX6O95503 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX6O95503 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX6O95503 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX6O95503 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX6O95503 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX6O95503 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX6O95503 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX6O95503 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms