Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24AO95486 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24AO95486 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24AO95486 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms