Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG12O94817 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG12O94817 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG12O94817 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG12O94817 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG12O94817 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG12O94817 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG12O94817 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG12O94817 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG12O94817 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG12O94817 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms