Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK1O75385 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK1O75385 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ULK1O75385 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ULK1O75385 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ULK1O75385 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ULK1O75385 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ULK1O75385 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ULK1O75385 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms