Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG13O75143 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG13O75143 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG13O75143 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG13O75143 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG13O75143 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG13O75143 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms