Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MARCH6O60337 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms