Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP5O60239 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP5O60239 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms