Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX16O60231 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX16O60231 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DHX16O60231 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DHX16O60231 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DHX16O60231 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX16O60231 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX16O60231 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX16O60231 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DHX16O60231 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DHX16O60231 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms