Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP9O43818 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRP9O43818 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRP9O43818 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRP9O43818 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP9O43818 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP9O43818 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRP9O43818 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRP9O43818 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRP9O43818 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRP9O43818 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRP9O43818 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRP9O43818 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRP9O43818 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms