Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LANCL1O43813 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LANCL1O43813 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms