Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR3O43731 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR3O43731 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms