Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTRA2O43464 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTRA2O43464 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTRA2O43464 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms