Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms