Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COCHO43405 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COCHO43405 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COCHO43405 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COCHO43405 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COCHO43405 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COCHO43405 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COCHO43405 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COCHO43405 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COCHO43405 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms