Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA3O43365 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA3O43365 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms