Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATMINO43313 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATMINO43313 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATMINO43313 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATMINO43313 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATMINO43313 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATMINO43313 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATMINO43313 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATMINO43313 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATMINO43313 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATMINO43313 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms