Protein–RNA interactions for Protein: O43236

SEPT4, Septin-4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT4O43236 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT4O43236 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT4O43236 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEPT4O43236 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEPT4O43236 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEPT4O43236 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEPT4O43236 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEPT4O43236 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms