Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNN4O15554 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNN4O15554 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms