Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2DO15399 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2DO15399 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms