Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD28O15084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD28O15084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms