Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IKBKBO14920 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms