Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHOX2AO14813 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms