Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAB1O14561 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAB1O14561 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms