Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCL22O00626 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCL22O00626 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCL22O00626 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL22O00626 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL22O00626 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL22O00626 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL22O00626 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCL22O00626 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL22O00626 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL22O00626 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms