Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PODXLO00592 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PODXLO00592 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PODXLO00592 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PODXLO00592 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PODXLO00592 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PODXLO00592 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PODXLO00592 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms