Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRIT1O00522 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms