Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HIP1O00291 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIP1O00291 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIP1O00291 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIP1O00291 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIP1O00291 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIP1O00291 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms